El candidato de ARENA Ernesto Muyshondt obtuvo 88,194 votos para ser electo como alcalde de San Salvador, 61.2 % de los votos válidos, según el escrutinio definitivo del Tribunal Supremo Electoral. ARENA recibió 48,458 votos más que la candidata del FMLN, Jackeline Rivera, quien solo obtuvo 39,736 votos, 27.61 %.

La cifra de Muyshondt supera lo obtenido por el FMLN en 2015 cuando recibió 85,789 votos. El alcalde actual Nayib Bukele hizo coalición con el PSP y sumó al final 89,164 votos.La cifra de 2018 para ARENA también supera lo obtenido por el candidato Edwin Zamora en 2015, que fueron 82,288 votos.

Muyshondt ganó las elecciones en todos los 50 centros de votación de San Salvador.  En 2015, Bukele ganó 29 de 50 centros de votación. El arenero Edwin Zamora ganó 21 centros de votación.

En un lejano tercer lugar, figuró la candidata del Partido Demócrata Cristiano (PDC), Yesenia Hernández, con un 3.65 % de los votos. Los demás aspirantes obtuvieron menos del 3%.